Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C11orf49Q9H6J7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms