Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRMDAQ9H2I8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRMDAQ9H2I8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms