Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F5

RNF38, E3 ubiquitin-protein ligase RNF38, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF38Q9H0F5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF38Q9H0F5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF38Q9H0F5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF38Q9H0F5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF38Q9H0F5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF38Q9H0F5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF38Q9H0F5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF38Q9H0F5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF38Q9H0F5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF38Q9H0F5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms