Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE41Q9C0J9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms