Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP44Q9C0F1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP44Q9C0F1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP44Q9C0F1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms