Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASXL3Q9C0F0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASXL3Q9C0F0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASXL3Q9C0F0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms