Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
KRT23Q9C075 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT23Q9C075 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT23Q9C075 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms