Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM9Q9C026 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM9Q9C026 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms