Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPRY4Q9C004 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRY4Q9C004 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRY4Q9C004 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms