Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP1Q9C000 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NLRP1Q9C000 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms