Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms