Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRIP1Q9BX63 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms