Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TINF2Q9BSI4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TINF2Q9BSI4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms