Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms