Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TXNDC17Q9BRA2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms