Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGME1Q9BQP7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGME1Q9BQP7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms