Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF25Q9BQ70 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF25Q9BQ70 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms