Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF15Q99988 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF15Q99988 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms