Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRX2Q99811 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRX2Q99811 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms