Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A3Q99624 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A3Q99624 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms