Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD1Q99460 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMD1Q99460 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms