Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT12Q99456 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms