Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC39.18■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.13■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
IFT140Q96RY7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC39.07■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
IFT140Q96RY7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms