Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK15Q96Q40 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK15Q96Q40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK15Q96Q40 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms