Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRERF1Q96PN7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRERF1Q96PN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRERF1Q96PN7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms