Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRP3Q96P20 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP3Q96P20 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms