Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT74Q96LB3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT74Q96LB3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms