Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms