Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPZA3Q96KX2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms