Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP36Q96EU6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms