Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC51Q96ER9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC51Q96ER9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC51Q96ER9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms