Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEURL3Q96EH8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEURL3Q96EH8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms