Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC124Q96CT7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC124Q96CT7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms