Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF653Q96CK0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms