Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIFAQ96CG3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TIFAQ96CG3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms