Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMIGD2Q96BF3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms