Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NXPE3Q969Y0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXPE3Q969Y0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms