Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C6Q969F1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms