Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEAL3Q969E4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEAL3Q969E4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms