Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-CQ95604 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-CQ95604 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-CQ95604 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-CQ95604 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-CQ95604 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms