Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDAQ92838 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EDAQ92838 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDAQ92838 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDAQ92838 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EDAQ92838 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDAQ92838 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDAQ92838 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDAQ92838 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDAQ92838 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDAQ92838 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDAQ92838 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDAQ92838 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDAQ92838 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDAQ92838 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDAQ92838 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDAQ92838 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDAQ92838 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDAQ92838 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDAQ92838 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDAQ92838 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDAQ92838 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EDAQ92838 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDAQ92838 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDAQ92838 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDAQ92838 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDAQ92838 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDAQ92838 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDAQ92838 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EDAQ92838 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDAQ92838 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDAQ92838 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDAQ92838 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDAQ92838 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDAQ92838 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDAQ92838 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDAQ92838 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDAQ92838 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDAQ92838 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDAQ92838 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDAQ92838 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDAQ92838 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDAQ92838 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDAQ92838 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDAQ92838 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDAQ92838 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDAQ92838 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDAQ92838 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDAQ92838 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDAQ92838 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDAQ92838 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDAQ92838 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDAQ92838 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms