Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S1Q92572 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms