Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM4

PDCD6IP, Programmed cell death 6-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCD6IPQ8WUM4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD6IPQ8WUM4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms