Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSKUQ8WUA8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms