Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD9Q8NBP5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD9Q8NBP5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD9Q8NBP5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms