Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNBD1Q8NA66 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CNBD1Q8NA66 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNBD1Q8NA66 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms