Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTD1Q8N815 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTD1Q8N815 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTD1Q8N815 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms