Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC155Q8N6L0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC155Q8N6L0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC155Q8N6L0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms