Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO39Q8N4B4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms