Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
VWDEQ8N2E2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
VWDEQ8N2E2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms